GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 07:49:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Entomospira nematocera strain BR208 chromosome.
CP118168.1:547707-547727
TTATGACGGGTTACGTCAATCTTTTGATTG547707GATATGTTGAAGAGTTGGCTGTTGGTCTAAAGGATACAGCTACAAAGGTTT
Parastrongyloides trichosuri strain KNP genome assembly, scaffold: PTRK_scaffold0000007.
LM523164.1:685080-685100
TTATTGGATTTTCAAAATCTATCTTTGAAG685080GATATGTTGAAGAGTTGGCTGTTGAAATTGATGAAGCTATTAAGAATGGTG
Lucinisca nassula genome assembly, chromosome: 14.
OY757023.1:106567798-106567818
GCAGTCTTGTCAGAGCCTTTGCTGCTCTCG106567798GATATGTTGAAGAGTTGGCTGCGCACATGCATTTGACAAAATGTATGTAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCCAACTCTTCAACATATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCCAACTCTTCAACATATC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.318 | 0.309 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGCCAACTCTTCAACATATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.422 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATATGTTGAAGAGTTGGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.424 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).